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Datenbankerfassung unserer Pflanzensammlung

Der wissenschaftliche Wert von Botanischen Gärten hängt von der Dokumentation der Herkunft ihrer kultivierten Pflanzen und der Zugänglichkeit der entsprechenden Daten für die internationale Forschung ab. Beides erfordert einen hohen Aufwand an Expertise, Zeit und Geld.

Die Bestandsdatenbank des Botanischen Gartens München-Nymphenburg umfasst 33.878 genetische Individuen – 16.858 Arten, 3.269 Gattungen, 341 Familien. Von den 33.878 Akzessionen haben 9.476 eine direkte oder indirekte Wildherkunft. (Stand: Januar 2022)

IrisBG – Botanical Garden Collection Management

Wir sind dabei unsere Datenbank auf das IrisBG System umzustellen, welches von vielen deutschen und internationalen Gärten benutzt wird. Dies wird eine noch bessere Erfassung der bisher 45.296 Einträge in der Teildatenbank Referenzen (Pflanzennamen) und 104.303 Einträge in den Neuzugängen (ab 1965, komplett ab 1987) ermöglichen.

Gardens4Science – Online-Sammlungskatalog Botanischer Gärten

Der Garten ist auch Teil einer Gruppe von sieben deutschen Gärten mit großen Sammlungen an Bromelien und Kakteen, die seit 2018 ihre Daten zu diesen beiden Familien im Online-Portal gemeinsam zugänglich machen werden. Die Daten aus den lokalen Garten-Datenbanken werden dazu exportiert, über die BioCASe-Provider-Software-Installation am Botanischen Garten Berlin in den internationalen ABCD Datenstandard überführt und über das B-HIT Tool dort für online-Abfragen bereitgestellt. Angestrebt wird, dass das gardens4science-Datenportal einen ‘live view’ der sieben Sammlungen ermöglicht, wobei jede der Sammlungen selber mit verschiedenen Datenbank-Programmen arbeitet und die Daten weiterhin dezentral verwaltet werden.

Dieses laufende Projekt passt gut zur den Forschungsaktivitäten im Bereich Biodiversitätsinformatik, wie sie seit 2006 an der Botanischen Staatssammlung München mit SNSB IT Center stattfinden. Die BioCASe-Provider-Software ist dort seit 2010 installiert. Über sie werden derzeit rund 15 Millionen Datensätze mit Sammlungs- und Beobachtungsdaten über das GBIF-Portal abrufbar zur Verfügung gestellt, die Mehrzahl georeferenziert. Die SNSB stehen damit an vorderer Stelle der über 30 institutionellen Lieferanten von Sammlungs- und Beobachtungsdaten in Deutschland, weit vor allen anderen Naturwissenschaftlichen Sammlungen und Museen in Deutschland. Die für GBIF International bereitgestellten Daten werden parallel auch an weitere Portalen mit verschiedenen Funktionalitäten, u.a. an das BioCASE Europe-Portal, das EDIT-Portal, das GBIF-D Botanik-Portal und an GFBio weitergeleitet.

Unterstützt wird das Projekt von der Elfriede und Franz Jakob Stiftung für Forschung am Lehrstuhl für Systematische Botanik und Mykologie der Ludwigs-Maximilians-Universität München.

International Plant Exchange Network (IPEN)

Der Münchner Botanische Garten ist seit 2001 Mitglied im International Plant Exchange Network (IPEN) und folgt dem Code of Conduct dieser Vereinigung Botanischer Gärten. Unsere Mitarbeit beim European Botanic Gardens Consortium beinhaltet auch das strenge Befolgen der Biodiversitätskonvention (Convention on Biological Diversity, CBD) und der Regeln des Nagoya-Protokoll, welche einen standardisierten Umgang mit Pflanzenmaterial in den Botanischen Gärten erfordern. Die Gemeinschaft der Botanischen Gärten hat dafür IPEN als Regelwerk entwickelt. Die IPEN Task Force, zu der auch unser Kurator Dr. Andreas Gröger gehört, beschäftigt sich seit 2015 mit der Koordination und Weiterentwicklung dieses Regelwerks. Da IPEN international ist, wird nur der englische Text des Regelwerks gepflegt.

Database registration of our plant collection

The scientific value of botanic gardens depends on the documentation of the origin of their cultivated plants and the accessibility of the corresponding data for international research. Both require a great deal of expertise, time and money.

Die BesThe population database of the Munich-Nymphenburg Botanical Garden includes 33,878 genetic individuals; 16,858 species, 3,269 genera, 341 families. Of the 33,878 accessions, 9,476 have a direct or indirect wild origin. (As of January 2022)

IrisBG – Botanical Garden Collection Management

We are in the process of converting our database to the IrisBG system, which is used by many German and international gardens. This will allow an even better coverage of the 45,296 entries in the partial database references (plant names) and 104,303 entries in the new additions (from 1965, complete from 1987).

Gardens4Science – Online collection catalog of botanical gardens

The garden is also part of a group of seven German gardens with large collections of bromeliads and cacti that will make their data on these two families jointly accessible in the online portal since 2018. For this purpose, the data from the local garden databases will be exported, transferred to the international ABCD data standard via the BioCASe provider software installation at the Botanic Garden Berlin, and made available there for online queries via the B-HIT tool. The aim is for the gardens4science data portal to provide a ‘live view’ of the seven collections, with each of the collections itself working with different database programs and the data continuing to be managed decentrally.

This ongoing project fits well with the research activities in the field of biodiversity informatics that have been taking place at the Munich Botanical State Collection with SNSB IT Center since 2006. The BioCASe provider software has been installed there since 2010. It is currently used to make around 15 million datasets with collection and observation data available for retrieval via the GBIF portal, the majority of which are georeferenced. This puts the SNSB at the forefront of the more than 30 institutional suppliers of collection and observation data in Germany, far ahead of all other natural science collections and museums in Germany. The data provided for GBIF International are also forwarded in parallel to other portals with various functionalities, including the BioCASE Europe portal, the EDIT portal, the GBIF-D botany portal, and GFBio.

The project is supported by the Elfriede and Franz Jakob Foundation for Research at the Chair of Systematic Botany and Mycology of the Ludwigs-Maximilians-University Munich.

International Plant Exchange Network (IPEN)

The Munich Botanical Garden has been a member of the International Plant Exchange Network (IPEN) since 2001 and follows the Code of Conduct of this association of botanic gardens. Our participation in the European Botanic Gardens Consortium also includes strict adherence to the Convention on Biological Diversity (CBD) and the rules of the Nagoya Protocol, which require standardized handling of plant material in botanic gardens. The botanic garden community has developed IPEN as a set of rules for this purpose. The IPEN Task Force, which includes our curator Dr. Andreas Gröger, has been working on the coordination and further development of this set of rules since 2015. Since IPEN is international, only the English text of the regulations is maintained.